Sinopsis Code Geass: Hangyaku no Lelouch II – Handou/Code Geass: Lelouch of the Rebellion – Rebellion/コードギアス 反逆のルルーシュⅡ 叛道/Code Geass: Lelouch of the Rebellion II – Transgression: Setelah meraih kemenangan ajaib dalam serangkaian pertempuran melawan Tentara Britania, Lelouch Lamperouge telah membawa Ksatria Hitam, organisasi paramiliternya, ke negara yang lebih kuat dari sebelumnya. Sepertinya tidak ada yang mustahil baginya ketika dia menggunakan kekuatan militer, kecerdasan, dan kekuatan Geass dengan kepatuhan mutlak.
Namun, hambatan dalam menghadapi pemberontakan tidak pernah berhenti, membuat Lelouch berada dalam kesulitan yang sulit. Yang paling mengkhawatirkan, kehebatan tempur Suzaku Kururugi dan kemunculan seorang anak misterius bernama V.V. mengancam untuk mengakhiri pemberontakan besar Lelouch.