Sinopsis Hyakka Ryouran: Samurai Girls/百花繚乱 サムライガールズ/Samurai Girls/Samurai Girls: Hyakka Ryouran/Samuraï Girls: Expertes en Strip Fighting!: Dengan bentang alamnya yang indah dan masyarakatnya yang makmur, Jepang Raya membuat iri semua negara lain. Namun ancaman serius masih menghantui negara ini. Penjaga misterius yang dikenal sebagai Master Samurai adalah satu-satunya pertahanan Jepang yang Hebat.
Atas perintah OSIS, samurai muda Muneakira Yagyuu tiba di Sekolah Akademi Buou. Dijalankan oleh Keshogunan Tokugawa, di sini anak-anak pejuang diberikan pendidikan aristokrat yang diperlukan untuk menjalankan negara. Sekolah ini dipimpin oleh ketua OSIS Yoshihiko Tokugawa dan saudara perempuannya Sen, yang juga merupakan teman masa kecil Muneakira.
Setibanya di akademi, Muneakira mendapati dirinya berada di tengah pertarungan yang mengerikan. Selama kekacauan, langit dipenuhi cahaya putih yang aneh dan seorang gadis misterius bernama Juubei Yagyuu muncul dan tiba-tiba mencium Muneakira. Dengan ciumannya, dia membangkitkan kekuatan tak dikenal yang melindungi mereka.
Siapa gadis ini, dan dari mana asalnya? Muneakira mendapati dirinya terjerat dalam nasib negara dan ancaman yang akan mengguncang Jepang hingga ke akar-akarnya. Dia harus mempelajari rahasia di balik Master Samurai dan ciuman yang membangkitkan kekuatan Juubei untuk melindungi negaranya.
