Sinopsis Kidou Senshi Gundam SEED Destiny/Kidou Senshi Gundam SEED DESTINY/機動戦士ガンダムSEED DESTINY/Mobile Suit Gundam SEED Destiny/Mobile Suit Gundam Seed Destiny/Mobile Suit Gundam Seed Destiny/Mobile Suit Gundam Seed Destiny: Pada tahun Cosmic Era 0071, perkelahian masa perang antara dua mobile suit mengakibatkan kehancuran negara netral. Shinn Asuka menemukan seluruh keluarganya terbunuh sebagai korban kekerasan, dan bersumpah hidupnya untuk membalas dendam terhadap kekuatan Alam Bumi, dengan kesan bahwa merekalah yang bertanggung jawab atas kematian keluarganya. Shinn bekerja keras melalui pasukan militer ZAFT, akhirnya mendapatkan akses ke kokpit prototipe mobile suit Impulse.
Athrun Zala, seorang veteran perang baru-baru ini yang bekerja untuk diplomat Cagalli Yula Athha, mendapati dirinya terseret ke dalam konflik baru antara Naturals dan Koordinator: manusia yang secara artifisial ditingkatkan sebelum lahir dan dibenci oleh Naturals karena keuntungan biologis mereka.
Ketika perang baru mulai terjadi dan kekerasan menjadi tak terhindarkan, Athrun mendapati dirinya sebagai mentor bagi Shinn yang pahit. Athrun harus mengarahkan pilot muda itu menuju pola pikir belas kasihan sebelum kemarahan dan keinginan balas dendam menguasai dirinya.
