Sinopsis Kidou Senshi Gundam Unicorn RE:0096/Mobile Suit Gundam UC RE:0096/機動戦士ガンダムUC（ユニコーン）RE:0096/Mobile Suit Gundam Unicorn RE:0096: Pada tahun 0096 Abad Universal, perdamaian yang rapuh muncul dari abu konflik. Siswa berusia enam belas tahun Banagher Links mengunjungi koloni luar angkasa Industrial 7 dalam karyawisata sekolah, tetapi karena pesawat ulang-alik rusak, dia terdampar sepenuhnya.
Bagi Banagher, yang selama ini menjalani kehidupan normal, perang selalu menjadi bagian sejarah yang jauh dan nyaris mistis; tetapi dalam beberapa menit, fantasi menjadi kenyataan ketika dia menyelamatkan seorang gadis bernama Audrey Burne, yang sangat perlu bertemu dengan pemimpin Yayasan Vist di dekatnya, Cardeas Vist. Dia berharap bisa membujuknya untuk menahan “Kotak Laplace”, sebuah benda yang berpotensi menghancurkan dunia. Sejarah dimulai ketika kekuatan galaksi berkumpul di Industrial 7, masing-masing bersaing untuk mendapatkan Kotak Laplace. Saat sisa-sisa Neo Zeon bentrok dengan Pasukan Federasi Bumi di sekitar koloni, Cardeas, di saat-saat terakhirnya, memberikan Banagher kunci Kotak, sebuah mobile suit yang dijuluki “The Unicorn Gundam.”
Dilengkapi dengan aksi eksplosif dan ketegangan yang meningkat, Mobile Suit Gundam Unicorn RE:0096 mengikuti Banagher saat keyakinannya diuji dan takdir yang tertidur selama lebih dari satu abad akhirnya terwujud.
