Sinopsis Mahou Shoujo Site/魔法少女サイト/Magical Girl Site: Setiap hari, Aya Asagiri berpikir tentang bunuh diri. Dia diintimidasi tanpa henti di sekolah, dan di rumah, kakak laki -lakinya Kaname secara fisik melecehkannya untuk meringankan stres akademis yang diberikan padanya oleh ayah mereka.
Suatu malam, ketika dia berbaring terjaga berharap untuk kematian, sebuah situs web misterius yang disebut situs Magical Girl muncul di laptopnya, berjanji untuk memberikan kekuatan ajaibnya. Pada awalnya, dia menolaknya sebagai lelucon menyeramkan, tetapi ketika dia menemukan pistol ajaib di loker sepatunya pada hari berikutnya, dia tidak tahu harus percaya apa. Memutuskan untuk membawanya, dia segera bertemu dengan pengganggu sekali lagi. Tapi kali ini, putus asa untuk apa pun untuk menyelamatkannya, dia menggunakan pistol – dan penyerangnya diangkut ke persimpangan kereta api terdekat, di mana mereka ditabrak.
Hati nurani Aya tidak dapat menangani fakta bahwa dia membunuh dua teman sekelasnya dengan sihir, dan dia mati -matian mencoba memahami situasinya. Namun, ketika dia mendapati dirinya dalam masalah lagi, dia diselamatkan oleh Tsuyuno Yatsumura, teman sekelas yang dapat menggunakan sihir untuk menghentikan waktu. Duo ini memiliki banyak hal yang harus dilakukan: tidak hanya mereka harus bertarung bersama dan melawan gadis -gadis ajaib lainnya, tetapi mereka juga perlu mengungkap kebenaran di balik situs web dan peristiwa apokaliptik yang dikenal sebagai “badai” yang akan segera terjadi.