Sinopsis Toaru Kagaku no Railgun S/Toaru Kagaku no Railgun 2/Toaru Kagaku no Choudenjihou 2/A Certain Scientific Railgun 2/とある科学の超電磁砲S/A Certain Scientific Railgun S/A Certain Scientific Railgun S/A Certain Scientific Railgun S/A Certain Scientific Railgun S: Mikoto Misaka dan teman-temannya kembali, menyelidiki rumor di Academy City. Tak lama kemudian, Mikoto menemukan sesuatu yang menakutkan: eksperimen mengerikan sedang terjadi di seluruh kota, yang melibatkan pembunuhan ribuan esper. Terlebih lagi, para esper ini jauh dari sekedar manusia biasa: mereka adalah klon dari Mikoto sendiri. Merasa bertanggung jawab atas perawatan mereka, dia memutuskan untuk mengakhiri eksperimennya; Namun, kekuatan yang menentangnya jauh lebih berbahaya daripada yang ia perkirakan, dan Mikoto mendapati dirinya menghadapi beberapa esper paling kuat yang bisa dibayangkan.
Toaru Kagaku no Railgun S melanjutkan kisah Railgun saat dia mati-matian berjuang untuk mengakhiri eksperimen tidak manusiawi yang dia yakini telah dia bantu, hidupnya terseret ke dalam keputusasaan dalam prosesnya. Tidak pernah ada momen yang membosankan di Academy City, tapi tidak ada seorang pun yang mengatakan bahwa semua momen itu akan menyenangkan.
