Menyusul serangkaian serangan yang membuat guru dan siswa kehilangan sihirnya, kepala sekolah Liza Quillyn memutuskan untuk menutup Perguruan Tinggi, sehingga mustahil untuk masuk atau keluar dari lokasi. Akibatnya, Philomela Sargant tidak dapat mematuhi perintah neneknya Lizbeth untuk mengundurkan diri dari sekolah.
Terjebak di dalam Perguruan Tinggi, Chise Hatori dan teman-teman sekelasnya mulai menyesuaikan diri dengan keadaan baru dan penuh tekanan. Namun seiring berjalannya waktu, kondisi Philomela semakin memburuk—baik secara mental maupun fisik. Sementara itu, detail tentang masa lalu tragis teman sekamar Chise, Lucy Webster, terus muncul kembali. Saat Chise bergulat dengan kekhawatiran tentang teman-temannya dan dirinya yang terus berkembang, identitas pelaku misterius penguras sihir yang mengganggu Universitas akhirnya akan terungkap.
