Siswa biasa, Mitsuki Mutou, tiba-tiba menemukan dirinya dipindahkan ke dunia lain. Dipanggil oleh raja dunia ini karena kekuatan luar biasa yang seharusnya dimilikinya, Mitsuki diusir karena tampaknya ia tidak memiliki Konsep Khusus. Sambil murung, dia bertemu dengan seorang pendeta bernama Menou yang menjelaskan bahwa orang Jepang seperti dia dikenal sebagai Orang Hilang, dan orang seperti itu selalu memiliki Konsep Khusus.
Menou menjelaskan bahwa dia adalah bagian dari gereja yang membantu Orang-Orang Hilang yang terlantar untuk berintegrasi ke dalam masyarakat. Dia mengundangnya untuk bermalam di gerejanya, di mana keduanya dapat menyelidiki sifat kemampuannya. Akhirnya, mereka menemukan bahwa Konsep Khusus Mitsuki sebenarnya sangat kuat dan berbahaya.
Namun apakah tujuan Menou sebenarnya adalah membantu Yang Hilang—atau sebaliknya?