Sinopsis Gintama.: Shirogane no Tamashii-hen – Kouhan-sen/Gintama.: Silver Soul Arc 2/銀魂. 銀ノ魂篇 後半戦/Gintama.: Silver Soul Arc – Second Half War: Setelah Tentara Pembebasan Altana mundur sementara dari Distrik Kabuki, keadaan perang tampaknya membaik. Namun, saat Oniwaban, Shinsengumi, dan penduduk distrik tersebut memerangi sisa-sisa tentara, penemu terhebat Edo, Gengai Hiraga, diculik. Bertanggung jawab menyebabkan mundurnya musuh dengan membuat senjata mereka tidak berguna, virus mesin nano Gengai kini berisiko dimatikan.
Sementara itu, laser yang mampu melenyapkan sebuah planet diaktifkan di orbit bumi di kapal induk Tentara Pembebasan. Pertempuran lain terjadi ketika Shinsuke Takasugi dan anggota Kiheitai lainnya tiba di kapal untuk menghentikan tembakan senjata. Terpaksa berperang di dua front, Yorozuya dan sekutunya harus menang di kedua sisi untuk menyelamatkan Edo dan seluruh dunia.
