Sinopsis Isekai wa Smartphone to Tomo ni. 2/In Another World With My Smartphone 2nd Season, In a Different World with a Smartphone./異世界はスマートフォンとともに。/In Another World With My Smartphone 2: Touya Mochizuki semakin terbiasa dengan kehidupan barunya di dunia lain. Berbekal ponsel pintar terpercayanya, remaja tersebut menerima misi kecil di waktu luangnya sambil menghabiskan waktu bersama tunangan barunya: Yumina Urnea Belfast, Yae Kokonoe, dan saudara kembar Linse dan Elze Shileska. Namun bahkan dalam lingkungan yang santai, Touya baru mulai memahami tanggung jawab yang timbul dari pertunangan ini.
Selain kesengsaraan romantisnya, peri tua Lean ingin menemukan sisa-sisa Babel, pulau terapung yang diciptakan oleh Profesor Regina Babylon yang misterius lima ribu tahun yang lalu. Touya dengan enggan menerima permintaannya dan mencari lingkaran teleportasi yang akan menuju ke pulau-pulau tersebut. Namun, monster aneh telah muncul—mungkin cukup kuat untuk menghancurkan dunia. Untuk menyelamatkan nyawa kedua yang diberikan kepadanya, Touya harus menggunakan teknologi kuno untuk melawan monster-monster ini—sambil menyeimbangkan jumlah hubungannya yang sangat banyak.
